Titre
Role of APOBEC3F Gene Variation in HIV-1 Disease Progression and Pneumocystis Pneumonia.
Type
article
Institution
Externe
Périodique
Auteur(s)
An, P.
Auteure/Auteur
Penugonda, S.
Auteure/Auteur
Thorball, C.W.
Auteure/Auteur
Bartha, I.
Auteure/Auteur
Goedert, J.J.
Auteure/Auteur
Donfield, S.
Auteure/Auteur
Buchbinder, S.
Auteure/Auteur
Binns-Roemer, E.
Auteure/Auteur
Kirk, G.D.
Auteure/Auteur
Zhang, W.
Auteure/Auteur
Fellay, J.
Auteure/Auteur
Yu, X.F.
Auteure/Auteur
Winkler, C.A.
Auteure/Auteur
Liens vers les personnes
ISSN
1553-7404
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2016-03
Volume
12
Numéro
3
Première page
e1005921
Peer-reviewed
Oui
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, N.I.H., Intramural
Publication Status: epublish
Publication Status: epublish
Résumé
Human APOBEC3 cytidine deaminases are intrinsic resistance factors to HIV-1. However, HIV-1 encodes a viral infectivity factor (Vif) that degrades APOBEC3 proteins. In vitro APOBEC3F (A3F) anti-HIV-1 activity is weaker than A3G but is partially resistant to Vif degradation unlike A3G. It is unknown whether A3F protein affects HIV-1 disease in vivo. To assess the effect of A3F gene on host susceptibility to HIV- acquisition and disease progression, we performed a genetic association study in six well-characterized HIV-1 natural cohorts. A common six-Single Nucleotide Polymorphism (SNP) haplotype of A3F tagged by a codon-changing variant (p. I231V, with allele (V) frequency of 48% in European Americans) was associated with significantly lower set-point viral load and slower rate of progression to AIDS (Relative Hazards (RH) = 0.71, 95% CI: 0.56, 0.91) and delayed development of pneumocystis pneumonia (PCP) (RH = 0.53, 95% CI: 0.37-0.76). A validation study in the International Collaboration for the Genomics of HIV (ICGH) showed a consistent association with lower set-point viral load. An in vitro assay revealed that the A3F I231V variant may influence Vif mediated A3F degradation. Our results provide genetic epidemiological evidence that A3F modulates HIV-1/AIDS disease progression.
Sujets
PID Serval
serval:BIB_ABF6E817F8F2
PMID
Open Access
Oui
Date de création
2017-10-19T08:03:33.072Z
Date de création dans IRIS
2025-05-21T01:27:24Z
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Nom
26942578_BIB_ABF6E817F8F2.pdf
Version du manuscrit
published
Licence
https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0
Taille
813.83 KB
Format
Adobe PDF
PID Serval
serval:BIB_ABF6E817F8F2.P001
Somme de contrôle
(MD5):a0b73252d95f0c300c1a11269b0c4472