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  4. Assessing genetic diversity in clonal organisms: low diversity or low resolution? Combining power and cost efficiency in selecting markers.
 
  • Détails
Titre

Assessing genetic diversity in clonal organisms: low diversity or low resolution? Combining power and cost efficiency in selecting markers.

Type
article
Institution
Externe
Périodique
Journal of Heredity  
Auteur(s)
Arnaud-Haond, S.
Auteure/Auteur
Alberto, F.
Auteure/Auteur
Teixeira, S.
Auteure/Auteur
Procaccini, G.
Auteure/Auteur
Serrão, E.A.
Auteure/Auteur
Duarte, C.M.
Auteure/Auteur
Liens vers les personnes
Lopes Teixeira, Sara  
ISSN
0022-1503
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2005
Volume
96
Numéro
4
Première page
434
Dernière page/numéro d’article
440
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article
Résumé
The increasing use of molecular tools to study populations of clonal organisms leads us to question whether the low polymorphism found in many studies reflects limited genetic diversity in populations or the limitations of the markers used. Here we used microsatellite datasets for two sea grass species to provide a combinatory statistic, combined with a likelihood approach to estimate the probability of identical multilocus genotypes (MLGs) to be shared by distinct individuals, in order to ascertain the efficiency of the markers used and to optimize cost-efficiently the choice of markers to use for deriving unbiased estimates of genetic diversity. These results strongly indicate that conclusions from studies on clonal organisms derived using markers showing low polymorphism, including microsatellites, should be reassessed using appropriate polymorphic markers.
Sujets

Alismatidae/genetics

Gene Frequency

Genes, Plant

Genetic Markers

Genetic Variation

Genotype

Geography

Plant Shoots/genetics...

Seedling/genetics

PID Serval
serval:BIB_AF85A45634AD
DOI
10.1093/jhered/esi043
PMID
15743902
Permalien
https://iris.unil.ch/handle/iris/140329
Open Access
Oui
Date de création
2007-11-19T09:44:44.365Z
Date de création dans IRIS
2025-05-20T21:39:24Z
Fichier(s)
En cours de chargement...
Vignette d'image
Nom

BIB_AF85A45634AD.P001.pdf

Version du manuscrit

preprint

Taille

306.11 KB

Format

Adobe PDF

PID Serval

serval:BIB_AF85A45634AD.P001

Somme de contrôle

(MD5):5263390bd8f5f46d69e627398ff6a258

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