Titre
Emergence of a Homo sapiens-specific gene family and chromosome 16p11.2 CNV susceptibility.
Type
article
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Auteur(s)
Nuttle, X.
Auteure/Auteur
Giannuzzi, G.
Auteure/Auteur
Duyzend, M.H.
Auteure/Auteur
Schraiber, J.G.
Auteure/Auteur
Narvaiza, I.
Auteure/Auteur
Sudmant, P.H.
Auteure/Auteur
Penn, O.
Auteure/Auteur
Chiatante, G.
Auteure/Auteur
Malig, M.
Auteure/Auteur
Huddleston, J.
Auteure/Auteur
Benner, C.
Auteure/Auteur
Camponeschi, F.
Auteure/Auteur
Ciofi-Baffoni, S.
Auteure/Auteur
Stessman, H.A.
Auteure/Auteur
Marchetto, M.C.
Auteure/Auteur
Denman, L.
Auteure/Auteur
Harshman, L.
Auteure/Auteur
Baker, C.
Auteure/Auteur
Raja, A.
Auteure/Auteur
Penewit, K.
Auteure/Auteur
Janke, N.
Auteure/Auteur
Tang, W.J.
Auteure/Auteur
Ventura, M.
Auteure/Auteur
Banci, L.
Auteure/Auteur
Antonacci, F.
Auteure/Auteur
Akey, J.M.
Auteure/Auteur
Amemiya, C.T.
Auteure/Auteur
Gage, F.H.
Auteure/Auteur
Reymond, A.
Auteure/Auteur
Eichler, E.E.
Auteure/Auteur
Liens vers les personnes
Liens vers les unités
ISSN
1476-4687
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2016
Volume
536
Numéro
7615
Première page
205
Dernière page/numéro d’article
209
Peer-reviewed
Oui
Langue
anglais
Résumé
Genetic differences that specify unique aspects of human evolution have typically been identified by comparative analyses between the genomes of humans and closely related primates, including more recently the genomes of archaic hominins. Not all regions of the genome, however, are equally amenable to such study. Recurrent copy number variation (CNV) at chromosome 16p11.2 accounts for approximately 1% of cases of autism and is mediated by a complex set of segmental duplications, many of which arose recently during human evolution. Here we reconstruct the evolutionary history of the locus and identify bolA family member 2 (BOLA2) as a gene duplicated exclusively in Homo sapiens. We estimate that a 95-kilobase-pair segment containing BOLA2 duplicated across the critical region approximately 282 thousand years ago (ka), one of the latest among a series of genomic changes that dramatically restructured the locus during hominid evolution. All humans examined carried one or more copies of the duplication, which nearly fixed early in the human lineage--a pattern unlikely to have arisen so rapidly in the absence of selection (P < 0.0097). We show that the duplication of BOLA2 led to a novel, human-specific in-frame fusion transcript and that BOLA2 copy number correlates with both RNA expression (r = 0.36) and protein level (r = 0.65), with the greatest expression difference between human and chimpanzee in experimentally derived stem cells. Analyses of 152 patients carrying a chromosome 16p11. rearrangement show that more than 96% of breakpoints occur within the H. sapiens-specific duplication. In summary, the duplicative transposition of BOLA2 at the root of the H. sapiens lineage about 282 ka simultaneously increased copy number of a gene associated with iron homeostasis and predisposed our species to recurrent rearrangements associated with disease.
Sujets
PID Serval
serval:BIB_CFCA0FE3B0E4
PMID
Date de création
2016-08-04T15:29:57.187Z
Date de création dans IRIS
2025-05-21T04:30:58Z
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Nom
27487209_BIB_CFCA0FE3B0E4.pdf
Version du manuscrit
postprint
Taille
4.65 MB
Format
Adobe PDF
PID Serval
serval:BIB_CFCA0FE3B0E4.P001
URN
urn:nbn:ch:serval-BIB_CFCA0FE3B0E45
Somme de contrôle
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