Titre
Draft genome of the globally widespread and invasive Argentine ant (Linepithema humile).
Type
article
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Auteur(s)
Smith, C.D.
Auteure/Auteur
Zimin, A.
Auteure/Auteur
Holt, C.
Auteure/Auteur
Abouheif, E.
Auteure/Auteur
Benton, R.
Auteure/Auteur
Cash, E.
Auteure/Auteur
Croset, V.
Auteure/Auteur
Currie, C.R.
Auteure/Auteur
Elhaik, E.
Auteure/Auteur
Elsik, C.G.
Auteure/Auteur
Fave, M.J.
Auteure/Auteur
Fernandes, V.
Auteure/Auteur
Gadau, J.
Auteure/Auteur
Gibson, J.D.
Auteure/Auteur
Graur, D.
Auteure/Auteur
Grubbs, K.J.
Auteure/Auteur
Hagen, D.E.
Auteure/Auteur
Helmkampf, M.
Auteure/Auteur
Holley, J.A.
Auteure/Auteur
Hu, H.
Auteure/Auteur
Viniegra, A.S.
Auteure/Auteur
Johnson, B.R.
Auteure/Auteur
Johnson, R.M.
Auteure/Auteur
Khila, A.
Auteure/Auteur
Kim, J.W.
Auteure/Auteur
Laird, J.
Auteure/Auteur
Mathis, K.A.
Auteure/Auteur
Moeller, J.A.
Auteure/Auteur
Muñoz-Torres, M.C.
Auteure/Auteur
Murphy, M.C.
Auteure/Auteur
Nakamura, R.
Auteure/Auteur
Nigam, S.
Auteure/Auteur
Overson, R.P.
Auteure/Auteur
Placek, J.E.
Auteure/Auteur
Rajakumar, R.
Auteure/Auteur
Reese, J.T.
Auteure/Auteur
Robertson, H.M.
Auteure/Auteur
Smith, C.R.
Auteure/Auteur
Suarez, A.V.
Auteure/Auteur
Suen, G.
Auteure/Auteur
Suhr, E.L.
Auteure/Auteur
Tao, S.
Auteure/Auteur
Torres, C.W.
Auteure/Auteur
van Wilgenburg, E.
Auteure/Auteur
Viljakainen, L.
Auteure/Auteur
Walden, K.K.
Auteure/Auteur
Wild, A.L.
Auteure/Auteur
Yandell, M.
Auteure/Auteur
Yorke, J.A.
Auteure/Auteur
Tsutsui, N.D.
Auteure/Auteur
Liens vers les personnes
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ISSN
1091-6490
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2011
Volume
108
Numéro
14
Première page
5673
Dernière page/numéro d’article
5678
Langue
anglais
Résumé
Ants are some of the most abundant and familiar animals on Earth, and they play vital roles in most terrestrial ecosystems. Although all ants are eusocial, and display a variety of complex and fascinating behaviors, few genomic resources exist for them. Here, we report the draft genome sequence of a particularly widespread and well-studied species, the invasive Argentine ant (Linepithema humile), which was accomplished using a combination of 454 (Roche) and Illumina sequencing and community-based funding rather than federal grant support. Manual annotation of >1,000 genes from a variety of different gene families and functional classes reveals unique features of the Argentine ant's biology, as well as similarities to Apis mellifera and Nasonia vitripennis. Distinctive features of the Argentine ant genome include remarkable expansions of gustatory (116 genes) and odorant receptors (367 genes), an abundance of cytochrome P450 genes (>110), lineage-specific expansions of yellow/major royal jelly proteins and desaturases, and complete CpG DNA methylation and RNAi toolkits. The Argentine ant genome contains fewer immune genes than Drosophila and Tribolium, which may reflect the prominent role played by behavioral and chemical suppression of pathogens. Analysis of the ratio of observed to expected CpG nucleotides for genes in the reproductive development and apoptosis pathways suggests higher levels of methylation than in the genome overall. The resources provided by this genome sequence will offer an abundance of tools for researchers seeking to illuminate the fascinating biology of this emerging model organism.
PID Serval
serval:BIB_310440611FA0
PMID
Open Access
Oui
Date de création
2011-03-22T14:51:36.466Z
Date de création dans IRIS
2025-05-20T20:16:42Z