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  4. Ab initio modeling and molecular dynamics simulation of the alpha 1b-adrenergic receptor activation.
 
  • Détails
Titre

Ab initio modeling and molecular dynamics simulation of the alpha 1b-adrenergic receptor activation.

Type
article
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Methods  
Auteur(s)
Fanelli, F.
Auteure/Auteur
Menziani, C.
Auteure/Auteur
Scheer, A.
Auteure/Auteur
Cotecchia, S.
Auteure/Auteur
De Benedetti, P.G.
Auteure/Auteur
Liens vers les personnes
Cotecchia, Susanna  
Liens vers les unités
DPT- Dpt pharmacologie et de toxicologie  
Groupe Cotecchia  
ISSN
1046-2023
Statut éditorial
Publié
Date de publication
1998
Volume
14
Numéro
3
Première page
302
Dernière page/numéro d’article
317
Langue
anglais
Résumé
This work describes the ab initio procedure employed to build an activation model for the alpha 1b-adrenergic receptor (alpha 1b-AR). The first version of the model was progressively modified and complicated by means of a many-step iterative procedure characterized by the employment of experimental validations of the model in each upgrading step. A combined simulated (molecular dynamics) and experimental mutagenesis approach was used to determine the structural and dynamic features characterizing the inactive and active states of alpha 1b-AR. The latest version of the model has been successfully challenged with respect to its ability to interpret and predict the functional properties of a large number of mutants. The iterative approach employed to describe alpha 1b-AR activation in terms of molecular structure and dynamics allows further complications of the model to allow prediction and interpretation of an ever-increasing number of experimental data.
Sujets

Amino Acid Sequence

Bacteriorhodopsins/ch...

Computer Simulation

GTP-Binding Proteins/...

Models, Molecular

Molecular Sequence Da...

Mutagenesis

Receptors, Adrenergic...

Receptors, Adrenergic...

Rhodopsin/chemistry

Sequence Homology, Am...

Static Electricity

PID Serval
serval:BIB_010485B66D7C
DOI
10.1006/meth.1998.0586
PMID
9571086
WOS
000073385500007
Permalien
https://iris.unil.ch/handle/iris/111806
Date de création
2008-01-24T10:05:32.464Z
Date de création dans IRIS
2025-05-20T19:27:31Z
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