Titre
Phylogenetic reconstruction of transmission events from individuals with acute HIV infection: toward more-rigorous epidemiological definitions.
Type
article
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Auteur(s)
Brown, A.E.
Auteure/Auteur
Gifford, R.J.
Auteure/Auteur
Clewley, J.P.
Auteure/Auteur
Kucherer, C.
Auteure/Auteur
Masquelier, B.
Auteure/Auteur
Porter, K.
Auteure/Auteur
Balotta, C.
Auteure/Auteur
Back, N.K.
Auteure/Auteur
Jorgensen, L.B.
Auteure/Auteur
de Mendoza, C.
Auteure/Auteur
Bhaskaran, K.
Auteure/Auteur
Gill, O.N.
Auteure/Auteur
Johnson, A.M.
Auteure/Auteur
Pillay, D.
Auteure/Auteur
Concerted Action on Seroconversion to, AIDS
Auteure/Auteur
Contributrices/contributeurs
Concerted Action on Seroconversion to, AIDS
Del Amo, J.
Meyer, L.
Bucher, H.
Chene, G.
Pillay, D.
Prins, M.
Rosinska, M.
Sabin, C.
Touloumi, G.
Porter, K.
Lodi, S.
Walker, S.
Babiker, A.
Darbyshire, J.
Bucher, H.
de Luca, A.
Fisher, M.
Muga, R.
Kaldor, J.
Kelleher, T.
Ramacciotti, T.
Gelgor, L.
Cooper, D.
Smith, D.
Gill, J.
Jorgensen, LB.
Nielsen, C.
Pedersen, C.
Lutsar, I.
Chene, G.
Dabis, F.
Thiebaut, R.
Masquelier, B.
Costagliola, D.
Guiguet, M.
Vanhems, P.
Meyer, L.
Boufassa, F.
Hamouda, O.
Kucherer, C.
Touloumi, G.
Pantazis, N.
Hatzakis, A.
Paraskevis, D.
Karafoulidou, A.
Rezza, G.
Dorrucci, M.
Longo, B.
Balotta, C.
Prins, M.
van Asten, L.
van der Bij, A.
Geskus, R.
Coutinho, R.
Sannes, M.
Brubakk, O.
Eskild, A.
Bruun, JN.
Camacho, R.
Smolskaya, T.
Muga, R.
Garcia de Olalla, P.
Del Amo, J.
del Romero, J.
Perez-Hoyos, S.
Hernandez Aguado, I.
Bucher, H.
Rickenbach, M.
Francioli, P.
Malyuta, R.
Brettle, R.
Delpech, V.
Lattimore, S.
Murphy, G.
Parry, J.
Gill, N.
Sabin, C.
Lee, C.
Porter, K.
Johnson, A.
Phillips, A.
Babiker, A.
Darbyshire, J.
Delpech, V.
Pillay, D.
Jaffe, H.
Groupes de travail
Death in Europe (CASCADE) Collaboration
Liens vers les personnes
Liens vers les unités
ISSN
0022-1899
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2009-02
Volume
199
Numéro
3
Première page
427
Dernière page/numéro d’article
431
Peer-reviewed
Oui
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't
Publication Status: ppublish
Publication Status: ppublish
Résumé
Phylogenetic reconstructions of transmission events from individuals with acute human immunodeficiency virus (HIV) infection are conducted to illustrate this group's heightened infectivity. Varied definitions of acute infection and assumptions about observed phylogenetic clusters may produce misleading results. We conducted a phylogenetic analysis of HIV pol sequences from 165 European patients with estimated infection dates and calculated the difference between dates within clusters. Nine phylogenetic clusters were observed. Comparison of dates within clusters revealed that only 2 could have been generated during acute infection. Previous analyses may have incorrectly assigned transmission events to the acutely HIV infected when they were more likely to have occurred during chronic infection.
PID Serval
serval:BIB_3B1DACE3A432
PMID
Open Access
Oui
Date de création
2009-03-05T15:02:07.465Z
Date de création dans IRIS
2025-05-20T16:29:44Z