Titre

Global mapping of highly pathogenic avian influenza H5N1 and H5Nx clade 2.3.4.4 viruses with spatial cross-validation.

Type
article
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Auteur(s)
Dhingra, M.S.
Auteure/Auteur
Artois, J.
Auteure/Auteur
Robinson, T.P.
Auteure/Auteur
Linard, C.
Auteure/Auteur
Chaiban, C.
Auteure/Auteur
Xenarios, I.
Auteure/Auteur
Engler, R.
Auteure/Auteur
Liechti, R.
Auteure/Auteur
Kuznetsov, D.
Auteure/Auteur
Xiao, X.
Auteure/Auteur
Dobschuetz, S.V.
Auteure/Auteur
Claes, F.
Auteure/Auteur
Newman, S.H.
Auteure/Auteur
Dauphin, G.
Auteure/Auteur
Gilbert, M.
Auteure/Auteur
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ISSN
2050-084X
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2016
Volume
5
Première page
e19571
Peer-reviewed
Oui
Langue
anglais
Résumé
Global disease suitability models are essential tools to inform surveillance systems and enable early detection. We present the first global suitability model of highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 and demonstrate that reliable predictions can be obtained at global scale. Best predictions are obtained using spatial predictor variables describing host distributions, rather than land use or eco-climatic spatial predictor variables, with a strong association with domestic duck and extensively raised chicken densities. Our results also support a more systematic use of spatial cross-validation in large-scale disease suitability modelling compared to standard random cross-validation that can lead to unreliable measure of extrapolation accuracy. A global suitability model of the H5 clade 2.3.4.4 viruses, a group of viruses that recently spread extensively in Asia and the US, shows in comparison a lower spatial extrapolation capacity than the HPAI H5N1 models, with a stronger association with intensively raised chicken densities and anthropogenic factors.
PID Serval
serval:BIB_6FACFC223249
DOI
PMID
WOS
Permalien
Open Access
Oui
Date de création
2017-03-16T07:17:22.571Z
Date de création dans IRIS
2025-05-21T00:02:35Z
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Version du manuscrit

published

Taille

3.08 MB

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Adobe PDF

PID Serval

serval:BIB_6FACFC223249.P001

URN

urn:nbn:ch:serval-BIB_6FACFC2232499

Somme de contrôle

(MD5):bfc730513f1cb1c6256bac24df2a3611