Titre
The Genome of the Toluene-Degrading Pseudomonas veronii Strain 1YdBTEX2 and Its Differential Gene Expression in Contaminated Sand.
Type
article
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Auteur(s)
Morales, M.
Auteure/Auteur
Sentchilo, V.
Auteure/Auteur
Bertelli, C.
Auteure/Auteur
Komljenovic, A.
Auteure/Auteur
Kryuchkova-Mostacci, N.
Auteure/Auteur
Bourdilloud, A.
Auteure/Auteur
Linke, B.
Auteure/Auteur
Goesmann, A.
Auteure/Auteur
Harshman, K.
Auteure/Auteur
Segers, F.
Auteure/Auteur
Delapierre, F.
Auteure/Auteur
Fiorucci, D.
Auteure/Auteur
Seppey, M.
Auteure/Auteur
Trofimenco, E.
Auteure/Auteur
Berra, P.
Auteure/Auteur
El Taher, A.
Auteure/Auteur
Loiseau, C.
Auteure/Auteur
Roggero, D.
Auteure/Auteur
Sulfiotti, M.
Auteure/Auteur
Etienne, A.
Auteure/Auteur
Ruiz Buendia, G.
Auteure/Auteur
Pillard, L.
Auteure/Auteur
Escoriza, A.
Auteure/Auteur
Moritz, R.
Auteure/Auteur
Schneider, C.
Auteure/Auteur
Alfonso, E.
Auteure/Auteur
Ben Jeddou, F.
Auteure/Auteur
Selmoni, O.
Auteure/Auteur
Resch, G.
Auteure/Auteur
Greub, G.
Auteure/Auteur
Emery, O.
Auteure/Auteur
Dubey, M.
Auteure/Auteur
Pillonel, T.
Auteure/Auteur
Robinson-Rechavi, M.
Auteure/Auteur
van der Meer, J.R.
Auteure/Auteur
Liens vers les personnes
ISSN
1932-6203
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2016
Volume
11
Numéro
11
Première page
e0165850
Peer-reviewed
Oui
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article
Publication Status: epublish
Publication types: Comparative Study ; Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't
Publication Status: ppublish
Publication Status: epublish
Publication types: Comparative Study ; Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't
Publication Status: ppublish
Résumé
The natural restoration of soils polluted by aromatic hydrocarbons such as benzene, toluene, ethylbenzene and m- and p-xylene (BTEX) may be accelerated by inoculation of specific biodegraders (bioaugmentation). Bioaugmentation mainly involves introducing bacteria that deploy their metabolic properties and adaptation potential to survive and propagate in the contaminated environment by degrading the pollutant. In order to better understand the adaptive response of cells during a transition to contaminated material, we analyzed here the genome and short-term (1 h) changes in genome-wide gene expression of the BTEX-degrading bacterium Pseudomonas veronii 1YdBTEX2 in non-sterile soil and liquid medium, both in presence or absence of toluene. We obtained a gapless genome sequence of P. veronii 1YdBTEX2 covering three individual replicons with a total size of 8 Mb, two of which are largely unrelated to current known bacterial replicons. One-hour exposure to toluene, both in soil and liquid, triggered massive transcription (up to 208-fold induction) of multiple gene clusters, such as toluene degradation pathway(s), chemotaxis and toluene efflux pumps. This clearly underlines their key role in the adaptive response to toluene. In comparison to liquid medium, cells in soil drastically changed expression of genes involved in membrane functioning (e.g., lipid composition, lipid metabolism, cell fatty acid synthesis), osmotic stress response (e.g., polyamine or trehalose synthesis, uptake of potassium) and putrescine metabolism, highlighting the immediate response mechanisms of P. veronii 1YdBTEX2 for successful establishment in polluted soil.
PID Serval
serval:BIB_14197457242A
PMID
Open Access
Oui
Date de création
2016-11-28T10:27:28.333Z
Date de création dans IRIS
2025-05-20T18:13:43Z
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Nom
journal.pone.0165850.PDF
Version du manuscrit
preprint
Taille
2.9 MB
Format
Adobe PDF
PID Serval
serval:BIB_14197457242A.P001
URN
urn:nbn:ch:serval-BIB_14197457242A4
Somme de contrôle
(MD5):ae28b9d2578e5919697a28bbae47b034