Titre
Cooperative development of logical modelling standards and tools with CoLoMoTo.
Type
synthèse (review)
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Auteur(s)
Naldi, A.
Auteure/Auteur
Monteiro, P.T.
Auteure/Auteur
Müssel, C.
Auteure/Auteur
Tools,
Auteure/Auteur
Kestler, H.A.
Auteure/Auteur
Kestler, H.A.
Auteure/Auteur
Thieffry, D.
Auteure/Auteur
Xenarios, I.
Auteure/Auteur
Saez-Rodriguez, J.
Auteure/Auteur
Helikar, T.
Auteure/Auteur
Chaouiya, C.
Auteure/Auteur
Contributrices/contributeurs
Tools,
Albert, R.
Barberis, M.
Calzone, L.
Chaouiya, C.
Chasapi, A.
Cokelaer, T.
Crespo, I.
Dorier, J.
Dräger, A.
Helikar, T.
Hernandez, C.
Hucka, M.
de Jong, H.
Keating, SM.
Kestler, HA.
Klamt, S.
Klarner, H.
Laubenbacher, R.
Novère, NL.
Monteiro, PT.
Müssel, C.
Naldi, A.
Niknejad, A.
Rodriguez, N.
Saez-Rodriguez, J.
Siebert, H.
Stoll, G.
Thieffry, D.
Xenarios, I.
Zañudo, JG.
Groupes de travail
Consortium for Logical Models
Liens vers les personnes
Liens vers les unités
ISSN
1367-4811
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2015
Volume
31
Numéro
7
Première page
1154
Dernière page/numéro d’article
1159
Peer-reviewed
Oui
Langue
anglais
Résumé
The identification of large regulatory and signalling networks involved in the control of crucial cellular processes calls for proper modelling approaches. Indeed, models can help elucidate properties of these networks, understand their behaviour and provide (testable) predictions by performing in silico experiments. In this context, qualitative, logical frameworks have emerged as relevant approaches, as demonstrated by a growing number of published models, along with new methodologies and software tools. This productive activity now requires a concerted effort to ensure model reusability and interoperability between tools. Following an outline of the logical modelling framework, we present the most important achievements of the Consortium for Logical Models and Tools, along with future objectives. Our aim is to advertise this open community, which welcomes contributions from all researchers interested in logical modelling or in related mathematical and computational developments.
PID Serval
serval:BIB_918E26626992
PMID
Open Access
Oui
Date de création
2015-08-07T10:26:35.383Z
Date de création dans IRIS
2025-05-21T03:51:23Z
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Nom
REF.pdf
Version du manuscrit
published
Taille
160.65 KB
Format
Adobe PDF
PID Serval
serval:BIB_918E26626992.P001
URN
urn:nbn:ch:serval-BIB_918E266269921
Somme de contrôle
(MD5):87fee10ddc96958c0fa4b2f84f9e0ba4