Titre
Randomly barcoded transposon mutant libraries for gut commensals II: Applying libraries for functional genetics.
Type
synthèse (review)
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Auteur(s)
Voogdt, CGP
Auteure/Auteur
Tripathi, S.
Auteure/Auteur
Bassler, S.O.
Auteure/Auteur
McKeithen-Mead, S.A.
Auteure/Auteur
Guiberson, E.R.
Auteure/Auteur
Koumoutsi, A.
Auteure/Auteur
Bravo, A.M.
Auteure/Auteur
Buie, C.
Auteure/Auteur
Zimmermann, M.
Auteure/Auteur
Sonnenburg, J.L.
Auteure/Auteur
Typas, A.
Auteure/Auteur
Deutschbauer, A.M.
Auteure/Auteur
Shiver, A.L.
Auteure/Auteur
Huang, K.C.
Auteure/Auteur
Liens vers les unités
ISSN
2211-1247
Statut éditorial
Publié
Date de publication
2024-01-23
Volume
43
Numéro
1
Première page
113519
Peer-reviewed
Oui
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article ; Review
Publication Status: ppublish
Publication Status: ppublish
Résumé
The critical role of the intestinal microbiota in human health and disease is well recognized. Nevertheless, there are still large gaps in our understanding of the functions and mechanisms encoded in the genomes of most members of the gut microbiota. Genome-scale libraries of transposon mutants are a powerful tool to help us address this gap. Recent advances in barcoded transposon mutagenesis have dramatically lowered the cost of mutant fitness determination in hundreds of in vitro and in vivo experimental conditions. In an accompanying review, we discuss recent advances and caveats for the construction of pooled and arrayed barcoded transposon mutant libraries in human gut commensals. In this review, we discuss how these libraries can be used across a wide range of applications, the technical aspects involved, and expectations for such screens.
PID Serval
serval:BIB_9F11DD25FCA4
PMID
Open Access
Oui
Date de création
2024-01-10T10:10:59.839Z
Date de création dans IRIS
2025-05-21T04:19:38Z
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Nom
38142398.pdf
Version du manuscrit
published
Licence
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
Taille
2.95 MB
Format
Adobe PDF
PID Serval
serval:BIB_9F11DD25FCA4.P001
URN
urn:nbn:ch:serval-BIB_9F11DD25FCA48
Somme de contrôle
(MD5):0007b1cf0f87f6171616fdc21e98cd38