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  4. The Eukaryotic Promoter Database (EPD): recent developments.
 
  • Détails
Titre

The Eukaryotic Promoter Database (EPD): recent developments.

Type
article
Institution
UNIL/CHUV/Unisanté + institutions partenaires
Périodique
Nucleic Acids Research  
Auteur(s)
Périer, R.C.
Auteure/Auteur
Junier, T.
Auteure/Auteur
Bonnard, C.
Auteure/Auteur
Bucher, P.
Auteure/Auteur
Liens vers les unités
Inst. recherche Expériment. Cancer  
ISSN
0305-1048
Statut éditorial
Publié
Date de publication
1999
Volume
27
Numéro
1
Première page
307
Dernière page/numéro d’article
309
Langue
anglais
Notes
Publication types: Journal Article
Résumé
The Eukaryotic Promoter Database (EPD) is an annotated non-redundant collection of eukaryotic POL II promoters, for which the transcription start site has been determined experimentally. Access to promoter sequences is provided by pointers to positions in nucleotide sequence entries. The annotation part of an entry includes description of the initiation site mapping data, cross-references to other databases, and bibliographic references. EPD is structured in a way that facilitates dynamic extraction of biologically meaningful promoter subsets for comparative sequence analysis. Recent efforts have focused on exhaustive cross-referencing to the EMBL nucleotide sequence database, and on the improvement of the WWW-based user interfaces and data retrieval mechanisms. EPD can be accessed at http://www.epd.isb-sib.ch
Sujets

Algorithms

Animals

Base Sequence

Databases, Factual

Eukaryotic Cells

Genes, Viral/genetics...

Genome

Information Storage a...

Internet

Promoter Regions, Gen...

RNA Polymerase II/phy...

RNA, Messenger/geneti...

Sequence Homology, Nu...

Transcription, Geneti...

User-Computer Interfa...

PID Serval
serval:BIB_12438
DOI
10.1093/nar/27.1.307
PMID
9847211
WOS
000077983000082
Permalien
https://iris.unil.ch/handle/iris/63476
Open Access
Oui
Date de création
2007-11-19T11:03:37.921Z
Date de création dans IRIS
2025-05-20T15:47:04Z
Fichier(s)
En cours de chargement...
Vignette d'image
Nom

REF.pdf

Version du manuscrit

published

Taille

140.78 KB

Format

Adobe PDF

PID Serval

serval:BIB_12438.P001

URN

urn:nbn:ch:serval-BIB_124383

Somme de contrôle

(MD5):f5edd55865a7be3de5cbac3147b488d5

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